AMD zen4架构部署 VASP6.3.0

VASP 6.3.0 安装包下载：
vasp.6.3.0.tgz
访问密码：

众所周知，VASP是一款“商用开源”软件（指付费解锁代码，免费什么也没有），其非常负责的态度使得个人没有渠道来正常获取VASP源文件.

Who can apply?
Licenses are issued to well-defined research groups under the direction of a single chair, professor, or group leader at one single physical location. Individual students or entire departments/faculties are not eligible.

参考VASP项目官网Get a lisence.

据校内某团队信息，课题组通过国内代理商花费大约7万余人民币购买了3年的更新. 我对这种定价和模式保留意见，这不符合开源精神，当然，VASP并不是开源软件.

根据sobereva的统计，2024年计算化学公社参与投票的565人，在25款第一性原理程序中投出他们最常用的：

这不能说明全部，但是在相当长的一段时间内VASP依然是相当多人的主要计算程序.

在部署以前

目的

博主部署VASP的目的主要是进行学习和可行性验证等，并非实际生产环境，主要保证能跑起来，而非高效的跑起来.

参考

VASP的最简单的安装方法
從零開始透過Spack套件管理器部屬VASP全家桶
在AMD机器上安装DFT计算软件VASP.6.2.0简明教程
使用aocc+aocl从头编译使用openmpi的vasp6

配置

在这里并没有用到显卡，但也有通过GPU加速第一性原理计算的方式. 通常来说，生产实际中为CPU每个核心预留8G内存.

路径

我们使用spack. 据说通过spack部署的VASP相对于直接编译得到的拥有较低的效率，不过这并不在我们的讨论范围内.

Spack is a package manager for supercomputers, Linux, and macOS. It makes installing scientific software easy. Spack isn’t tied to a particular language; you can build a software stack in Python or R, link to libraries written in C, C++, or Fortran, and easily swap compilers or target specific microarchitectures.

经过AMD和各位先辈的努力，现如今利用AOCC和AOCL编译已经可行且效率可观.

部署

布置环境

在root下运行：

export SPACK_ROOT=/opt/spack
git clone -c feature.manyFiles=true https://github.com/spack/spack.git ${SPACK_ROOT}
source ${SPACK_ROOT}/share/spack/setup-env.sh

写入~/.bashrc或~/.zshrc等：

export SPACK_ROOT=/opt/spack
source ${SPACK_ROOT}/share/spack/setup-env.sh

随后

source ~/.bashrc #(或.zshrc)

安装AOCC依赖：

apt install lbzip2

安装AOCC：

spack install aocc +license-agreed

自动查找添加编译器：

spack compiler find

确定现有编译器：

spack compilers

加载AOCC

spack load aocc

安装VASP

cd进入有vasp.6.3.0.tgz的目录，随后进行安装。

注意，版本必须填写6.3.0，spack是从本地调用的vasp包，不指明版本将尝试使用[email protected]，进而安装失败. spack -j参数同make，后跟随CPU核数（核数高于16核区别不大），其余版本和参数按需调整.

spack install -j 32 [email protected] +openmp +fftlib +hdf5 %aocc ^amdfftw ^amdblis threads=openmp ^amdlibflame ^amdscalapack ^openmpi fabrics=cma,ucx

在7950x上消耗约40分钟，安装完成后加载vasp

spack load vasp %aocc

后续参考下面，注意修改为自己的路径，如/opt/spack/opt/spack/linux-zen4/vasp-6.3.0-k3tpqsutalrz36sefzq63rglfnfjo2f7.

复制.spack到用户目录，以使用编译器等，或切换至目标用户手动查找.

cp -r ~/.spack /home/someone/

将vasp.6.3.0.tgz复制解压在合适的位置，如~/vasp

cd ~/vasp
tar -xvzf vasp.6.3.0.tgz
cd vasp.6.3.0

创建软链接

ln -s /opt/spack/opt/spack/linux-zen4/vasp-6.3.0-k3tpqsutalrz36sefzq63rglfnfjo2f7/bin/vasp_std bin/vasp_std
ln -s /opt/spack/opt/spack/linux-zen4/vasp-6.3.0-k3tpqsutalrz36sefzq63rglfnfjo2f7/bin/vasp_gam bin/vasp_gam
ln -s /opt/spack/opt/spack/linux-zen4/vasp-6.3.0-k3tpqsutalrz36sefzq63rglfnfjo2f7/bin/vasp_ncl bin/vasp_ncl

再次加载（不确定是否需要）

spack load vasp %aocc

后记

对于不同算例，不同编译器得到的vasp效率不同. 一些情况下，基于oneAPI（由因特尔开发）的vasp效率会高于AOCC. 实际在使用AMD CPU时，应当采用不同编译器多编译几个版本，在进行测试的后选取效率更高的进行运算.